Di Flap:Up, pengguna mengetuk layar untuk mempertahankan karakter berwarna-warni di udara saat mencoba terbang melewati berbagai rintangan. Tujuannya sederhana namun sulit: raih poin sebanyak-banyaknya sambil menghindari rintangan dan mengumpulkan power-up. Gameplay dari game ini terdiri dari area yang terus bergulir dengan berbagai macam rintangan, termasuk dinding, pipa yang bergerak, dan jebakan lainnya. Karakter mengepakkan sayapnya dan terbang ke atas saat ketukan digunakan untuk mengatur pergerakannya. Pemain harus terus-menerus mengubah waktunya untuk menghindari rintangan dalam tantangan ritmis ini, yang diciptakan dengan melepaskan ketukan dan membiarkan gravitasi menarik karakter kembali ke bawah.